MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070010 complete genome

Total Repeats: 11722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019951	GAC	2	6	1915458	1915463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_019951	GCGT	2	8	1915513	1915520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_019951	TCG	2	6	1915527	1915532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_019951	CCA	2	6	1915541	1915546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_019951	CTAT	2	8	1915617	1915624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_019951	CGC	2	6	1920072	1920077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_019951	CGG	2	6	1920096	1920101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_019951	TTG	2	6	1921874	1921879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_019951	GACG	2	8	1921897	1921904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_019951	CGC	2	6	1925389	1925394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_019951	TCCCAC	2	12	1925432	1925443	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_019951	CGGTC	2	10	1925484	1925493	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5013	NC_019951	GGC	2	6	1925530	1925535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_019951	TCGG	2	8	1925547	1925554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_019951	T	6	6	1925579	1925584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019951	GT	3	6	1925598	1925603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019951	CCGG	2	8	1925617	1925624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_019951	CAA	2	6	1925628	1925633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_019951	CAG	2	6	1925651	1925656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019951	GAGG	2	8	1925662	1925669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019951	G	7	7	1925737	1925743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019951	GCCG	2	8	1926532	1926539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_019951	CG	3	6	1928905	1928910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_019951	CCG	2	6	1928927	1928932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_019951	CCT	2	6	1928956	1928961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_019951	GTGC	2	8	1929014	1929021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_019951	TGC	2	6	1929129	1929134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_019951	GCC	2	6	1930112	1930117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_019951	GTC	2	6	1930169	1930174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_019951	CCGA	2	8	1931967	1931974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_019951	TCCGC	2	10	1932042	1932051	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5032	NC_019951	GCGG	2	8	1932058	1932065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_019951	C	7	7	1932111	1932117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5034	NC_019951	GAC	2	6	1935686	1935691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_019951	GC	3	6	1935701	1935706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_019951	CGC	2	6	1935742	1935747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_019951	GCC	2	6	1938931	1938936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_019951	CGG	2	6	1938937	1938942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_019951	GAAT	2	8	1938971	1938978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_019951	CGGA	2	8	1942152	1942159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_019951	CGG	2	6	1948699	1948704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_019951	C	6	6	1955096	1955101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5043	NC_019951	CGA	2	6	1968784	1968789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_019951	GAG	2	6	1968811	1968816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_019951	CG	3	6	1968818	1968823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_019951	CGA	2	6	1968841	1968846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_019951	GAG	2	6	1968868	1968873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_019951	CG	3	6	1968875	1968880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_019951	GGC	2	6	1968896	1968901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_019951	GCAGT	2	10	1968908	1968917	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5051	NC_019951	GGC	2	6	1968923	1968928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_019951	GGGTG	2	10	1968939	1968948	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_019951	GCT	2	6	1969084	1969089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_019951	GGC	2	6	1969093	1969098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_019951	CGT	2	6	1969109	1969114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_019951	CCAG	2	8	1969127	1969134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_019951	GACT	2	8	1969145	1969152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5058	NC_019951	CCA	2	6	1969167	1969172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_019951	GTC	2	6	1969227	1969232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_019951	GCCG	2	8	1969248	1969255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_019951	TGG	2	6	1969285	1969290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019951	CTGA	2	8	1969324	1969331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_019951	AGG	2	6	1969414	1969419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019951	CAT	2	6	1971550	1971555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_019951	GCC	2	6	1973226	1973231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_019951	ATTG	2	8	1973266	1973273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_019951	CGC	2	6	1973303	1973308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_019951	CCGCGG	2	12	1973350	1973361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_019951	GCGCC	2	10	1973380	1973389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5070	NC_019951	CCT	2	6	1974284	1974289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_019951	TGC	2	6	1974314	1974319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_019951	GC	3	6	1974329	1974334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_019951	TGCG	2	8	1974341	1974348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_019951	CGC	2	6	1975605	1975610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_019951	TGCC	2	8	1975643	1975650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_019951	CGA	2	6	1975656	1975661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_019951	GCCG	2	8	1979557	1979564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_019951	TGA	2	6	1979584	1979589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_019951	AAC	2	6	1979632	1979637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_019951	CGG	2	6	1979699	1979704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_019951	CGG	2	6	1979748	1979753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_019951	ATG	2	6	1980740	1980745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_019951	GAG	3	9	1980794	1980802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019951	GAG	3	9	1980850	1980858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_019951	GTG	2	6	1985431	1985436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_019951	TGA	2	6	1986225	1986230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_019951	CGT	2	6	1986240	1986245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_019951	GGGGT	2	10	1988292	1988301	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019951	C	6	6	1988319	1988324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5090	NC_019951	G	6	6	1988360	1988365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019951	TGA	2	6	1988375	1988380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_019951	CGG	2	6	1988415	1988420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_019951	TCA	2	6	1988495	1988500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_019951	GCG	2	6	1988521	1988526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_019951	CCA	2	6	1988649	1988654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_019951	CA	3	6	1988700	1988705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_019951	CTGTG	2	10	1988745	1988754	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5098	NC_019951	TTG	2	6	1988765	1988770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_019951	TGT	2	6	1988776	1988781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019951	ACA	2	6	1988809	1988814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_019951	GCA	2	6	1989225	1989230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_019951	GC	3	6	1994799	1994804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_019951	C	6	6	1994838	1994843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5104	NC_019951	GGGT	2	8	1997053	1997060	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_019951	TAGCGG	2	12	2000469	2000480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5106	NC_019951	GCCG	2	8	2001914	2001921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_019951	GGT	2	6	2002065	2002070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_019951	GGC	2	6	2002108	2002113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_019951	GCAG	2	8	2002116	2002123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_019951	AGT	2	6	2002193	2002198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_019951	GTC	2	6	2002207	2002212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_019951	CGT	2	6	2002242	2002247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_019951	CGA	2	6	2002248	2002253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019951	TGA	2	6	2002302	2002307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_019951	CTG	2	6	2002336	2002341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_019951	TCGA	2	8	2002366	2002373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_019951	ACCGCA	2	12	2002438	2002449	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_019951	CGA	2	6	2002463	2002468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019951	GCC	2	6	2003117	2003122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_019951	TCGG	2	8	2006035	2006042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_019951	TGGG	2	8	2007245	2007252	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019951	CGT	2	6	2007265	2007270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_019951	CGATA	2	10	2007271	2007280	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5124	NC_019951	TCT	2	6	2007329	2007334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_019951	A	6	6	2007337	2007342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_019951	CG	3	6	2007359	2007364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_019951	AC	3	6	2007428	2007433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_019951	GTG	2	6	2007466	2007471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_019951	CGA	2	6	2007509	2007514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_019951	CCG	2	6	2007581	2007586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_019951	GCC	2	6	2007605	2007610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_019951	TAC	2	6	2007647	2007652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_019951	CGG	2	6	2007790	2007795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_019951	CAG	2	6	2007796	2007801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5136	NC_019951	ACG	2	6	2007848	2007853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_019951	ATCC	2	8	2008031	2008038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5141	NC_019951	GGGTT	2	10	2008100	2008109	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_019951	CCG	2	6	2033607	2033612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5163	NC_019951	TGG	2	6	2033621	2033626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5217	NC_019951	AACC	2	8	2062926	2062933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5234	NC_019951	GACA	2	8	2068656	2068663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5235	NC_019951	CGG	2	6	2068718	2068723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5246	NC_019951	CGC	2	6	2073973	2073978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5255	NC_019951	GC	3	6	2077168	2077173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5256	NC_019951	CGC	2	6	2077184	2077189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5261	NC_019951	CGC	2	6	2077374	2077379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5372	NC_019951	TCG	2	6	2124275	2124280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5378	NC_019951	CTA	2	6	2124668	2124673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5382	NC_019951	AT	3	6	2124864	2124869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_019951	GTT	2	6	2125127	2125132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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